Hieff NGSTM MaxUP II DNA Library Prep Kit
——文库转化率高达60%,极其适用FFPE、cfDNA样本
DNA 文库构建是NGS样本制备的核心环节。文库质量直接影响测序数据质量——如mapping rate、coverage、complexity、bias等。要想获得好的文库,必须选择好的建库试剂盒,而建库试剂盒的关键,在于其文库转化率,即DNA片段双端接头连接效率,因为只有双端连接成功的DNA,才能够被有效扩增最终成为测序模板。
产品特点
Hieff NGSTM MaxUP II DNA Library Prep Kit for Illumina®,采用高质量的酶学组成,改进型接头连接技术,以及具有强扩增效率的高保真酶,显著提高文库转化率与扩增效率,助理完成更好。
适用500 pg-1 μg所有DNA样本
业界**文库转化率,高达60%
产品优异性能已在基因组、FFPE、cfDNA等多种样本中验证
2.5小时内收获优异文库 ,PCR或PCR-free方式均可
全程控制原料、人员、工艺与质量,全力保障批次性能与稳定性
1. 文库转化效率高达60%
文库转化率,即DNA片段双端接头连接效率。只有双端连接成功的DNA,才能够被有效扩增最终成为测序模板。
图1 Agilent 2100 检测350bp平末端DNA片段单端和双端连接产物峰。
0:350bpDNA片段峰、1:单端接头连接产物峰、2:双端接头连接产物峰。测试基于各公司的标准protocol进行。
图2 接头连接效率百分比(%)。
对图1峰面积进行积分后的定量结果显示Hieff NGS™ MaxUp II Kit 的双端连接效率可达60%。
2. 不同GC样本,扩增效率测试
Hieff NGS™ MaxUp II Kit中使用具有强扩增效率的Super CanaceTM High-Fidelity Mix用于文库扩增。以1 ng GC含量分别为38%、50%、70%的400 bp DNA片段为起始样本,12 cycles扩增,Qubit检测不同试剂盒所得产物浓度,Super Canace表现极佳。
表1 扩增模块效率比较。
产品名称 |
GC 38% (ng) |
GC 50% (ng) |
GC 70% (ng) |
Super CanaceTM High-Fidelity Mix |
25.6 |
18 |
17.1 |
K*-HiFi mix |
15.8 |
16.7 |
21.1 |
3. FFPE、cfDNA样本, 文库产量测试
Hieff NGS™ MaxUp II Kit以FFPE和cfDNA为起始样本建库,相对同类型试剂盒品牌 K*,在相同扩增循环数下,获得更多文库产量。
样本 |
100 ng FFPE |
5 ng cfDNA |
||
7 cycles (ng) |
10 cycles (ng) |
9 cycles (ng) |
12 cycles (ng) |
|
MaxUP II |
400 |
2000 |
120 |
1200 |
K* 品牌 |
150 |
1100 |
100 |
1080 |
注:FFPE样本来自小鼠肺蜡块,固定时间6个月;cfDNA样本来源于血浆。
4. 无偏好性的测序质量
在不同GC含量样本中,使用Hieff NGS™ MaxUP II Kit均能获得碱基质量好且覆盖度均一的测序数据。
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