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Hieff NGSTM MaxUP II DNA Library Prep Kit ——文库转化率高达60%,极其适用FFPE、cfDNA样本

作者:翌圣生物科技(上海)股份有限公司 2017-10-23T00:00 (访问量:3562)

 

Hieff NGSTM MaxUP II DNA Library Prep Kit

——文库转化率高达60%,极其适用FFPE、cfDNA样本

 

DNA 文库构建是NGS样本制备的核心环节文库质量直接影响测序数据质量——如mapping ratecoveragecomplexitybias。要想获得好的文库,必须选择好的建库试剂盒,而建库试剂盒的关键,在于其文库转化率,即DNA片段双端接头连接效率,因为只有双端连接成功的DNA,才能够被有效扩增最终成为测序模板。

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产品特点

Hieff NGSTM MaxUP II DNA Library Prep Kit for Illumina®采用高质量的酶学组成改进型接头连接技术以及具有强扩增效率的高保真酶显著提高文库转化率与扩增效率助理完成更好。

*  适用500 pg-1 μg所有DNA样本

*  业界**文库转化率,高达60%

*  产品优异性能已在基因组、FFPEcfDNA等多种样本中验证

*  2.5小时内收获优异文库 PCRPCR-free方式均可

*  全程控制原料、人员、工艺与质量,全力保障批次性能与稳定性

 
  https://encrypted-tbn0.gstatic.com/images?q=tbn:ANd9GcRTIgClFt18J5pTK03XS-b3L8DDB1L1-xIN86IxBa1gs71022ZD8A

 

 

 

 

 

 

 



1. 文库转化效率高达60%


文库转化率,即DNA片段双端接头连接效率。只有双端连接成功的DNA,才能够被有效扩增最终成为测序模板。

1 Agilent 2100 检测350bp平末端DNA片段单端和双端连接产物峰。

0350bpDNA片段峰、1:单端接头连接产物峰、2:双端接头连接产物峰。测试基于各公司的标准protocol进行。

2 接头连接效率百分比(%)。

对图1峰面积进行积分后的定量结果显示Hieff NGS™ MaxUp II Kit 的双端连接效率可达60%

2. 不同GC样本,扩增效率测试

 

Hieff NGS™ MaxUp II Kit中使用具有强扩增效率的Super CanaceTM High-Fidelity Mix用于文库扩增。以1 ng GC含量分别为38%50%70%400 bp DNA片段为起始样本,12 cycles扩增,Qubit检测不同试剂盒所得产物浓度,Super Canace表现极佳。

扩增模块效率比较。

产品名称

GC 38% (ng)

GC 50% (ng)

GC 70% (ng)

Super CanaceTM High-Fidelity Mix

25.6

18

17.1

K*-HiFi mix

15.8

16.7

21.1

3. FFPEcfDNA样本文库产量测试

 

Hieff NGS™ MaxUp II KitFFPEcfDNA为起始样本建库,相对同类型试剂盒品牌 K*,在相同扩增循环数下,获得更多文库产量。

 

样本

100 ng FFPE

5 ng cfDNA

7 cycles (ng)

10 cycles (ng)

9 cycles (ng)

12 cycles (ng)

MaxUP II

400

2000

120

1200

K* 品牌

150

1100

100

1080

注:FFPE样本来自小鼠肺蜡块,固定时间6个月;cfDNA样本来源于血浆。

4. 无偏好性的测序质量

在不同GC含量样本中,使用Hieff NGS™ MaxUP II Kit均能获得碱基质量好且覆盖度均一的测序数据。

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