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技术介绍 | 靶标代谢流分析

作者:上海阿趣生物科技有限公司 2021-11-16T17:05 (访问量:5325)

基于13C或者15N标记的靶标代谢流分析能够系统地定量细胞或者组织内特定代谢通路代谢网络的流量分布及各代谢途径的相对贡献,其优点是可以利用细胞内代谢物的质量同位体信息的分析方法,不但在很多情况下能够直观地表明代谢流量的整体走向,而且通过计算能够准确定量地揭示细胞内各个代谢反应的活性,以及深入理解平行反应、可逆反应等多种复杂的细胞内代谢过程,直观揭示细胞胞内的主要活性途径及各个途径的相对贡献及其分布变化特点,从而鉴定出相关疾病发生发展过程的早期诊断的标志物及其关键的主要代谢通路,并揭示其相互调控规律,为疾病发生的临床早期诊断、药物靶点治疗和预后判断提供强有力的科学依据。


Ex vivo and in vivo stable isotope labelling of central carbon metabolism and related pathways with analysis by LC-MS/MS

一、靶标代谢流解决方案
BIOTREE能量代谢之靶标代谢流解决方案:主要集中在能量代谢明星通路精细化代谢速率研究, 包含糖酵解途径、三羧酸循环、磷酸戊糖途径。
糖酵解途径(EMP)是指糖原或葡萄糖分子分解至生成丙酮酸的阶段,是体内糖代谢最主要途径。此途径在动植物和许多微生物中普遍存在。在需氧生物中,糖酵解途径是葡萄糖氧化生成二氧化碳和水的前奏。糖酵解生成的丙酮酸可进入线粒体,通过三羧酸循环(TCA)及电子传递链彻底氧化成二氧化碳和水,并生成腺嘌呤核苷三磷酸。

代谢流-糖酵解途径(部分物质)
三羧酸循环是(TCA) 需氧生物体内普遍存在的代谢途径,是生物机体获取能量的主要方式,是糖,脂肪和蛋白质三种主要有机物在体内彻底氧化的共同代谢途径,是体内三种主要有机物互变的中心枢纽。

代谢流-三羧酸循环(部分物质)
磷酸戊糖途径(PPP) 是葡萄糖氧化分解的一种方式,在动物、植物和微生物中普遍存在。在生物体内磷酸戊糖途径(PPP)除了提供能量外,主要是为合成代谢提供多种原料。如为脂肪酸、胆固醇的生物合成提供还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷磷酸(NADPH);为核苷酸辅酶、核苷酸的合成提供5-磷酸核糖;为芳香族氨基酸合成提供4-磷酸赤藓糖。

代谢流-磷酸戊糖途径(部分物质)


二、技术优势
  • 技术成熟、灵敏度高
  • 专业的数据分析团队,通过Matlab flux-8等软件进行原始数据处理,并进行PCA、柱状图、热力图、 Bi-plot等分析
三、技术路线

四、技术参数
  • 样本要求
细胞数量:1×107cells/sample
生物学重复 :6-10个生物学重复
  • 检测平台

GC-Q-MSE/ Sciex 6600 Triple tof

  • 检测平台
基于13C标记的葡萄糖(Glucose)碳代谢流分析
基于13C标记的谷氨酰胺(Glutamine)碳代谢流分析
基于15N标记的谷氨酰胺(Glutamine)氮代谢流分析
  • 常规项目周期
实验检测:58个自然日
数据分析:5个自然日
五、应用方向
  • 通过比较不同环境条件及各种代谢性疾病的不同代谢途径的代谢流量的分布变化,揭示出相关疾病发生发展过程中的主要代谢通路及其早期诊断的标志物
  • 通过13C代谢流量技术对胞内外的中间代谢物的变化示踪,可以鉴定出基因工程菌的关键的代谢通路和活性,为提高目标代谢产物的合成提供直接的依据
  • 可以比较分析细胞,组织及其血样和尿液在基因改造的前后的代谢功能变化


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